Elsa-niminen tyttö työskentelee laboratoriossa tutkimusassistenttina. Kerran laboratoriossa tapahtui räjähdys ja turvajärjestelmä laukesi. Nyt tyttö on lukittu laboratorioon. Sinä pelissä Scientist Girl Escape autat häntä pääsemään ulos huoneesta. Tätä varten sinun on käveltävä laboratorion huoneiden läpi ja tarkastettava ne huolellisesti. Ratkaisemalla erilaisia pulmia ja arvoituksia keräät esineitä, jotka auttavat tyttöä pääsemään pois laboratoriosta.