Clone Jumping -pelissä sinulla on mahdollisuus ohjata kahta kuutiohahmoa samanaikaisesti, joiden oletetaan olevan toistensa klooneja. Jos toinen liikkuu, niin toinen tekee samoin. Tämä on tärkein este tehtävien suorittamiselle kullakin tasolla. Tavoitteena on toimittaa molemmat kuutiot pyöreisiin portaaleihin. Ja muista, että ne kopioivat toisiaan tarkasti kloonihypyssä.