Cube Runnerin sininen kuutio voittaa esteitä matkalla maaliin ja sinun tehtäväsi on estää sitä törmäämästä punaiseen kuutioon - tämä on sen kauhein vihollinen. Yhteys sen kanssa potkaisee sinut tasolta. Loput lohkot voidaan siirtää, ja niiden avulla voit poistaa vihollisen tieltä.