Brain Trainin tiet ovat täynnä laittomuutta ja kaaosta. Autot tukkivat rautatiekiskot ja sinun on raivattava ne, jolloin juna voi kulkea vapaasti. Selvitysmekanismi määräytyy säännön mukaan - kolme peräkkäin. Olemassa olevaan kuljetukseen on lisättävä lisää autoja, jotta peräkkäin tulee kolme samanlaista. Ne katoavat ja juna jatkaa matkaansa.