Pixel Star Battle -pelissä sinun on aluksellasi torjuttava muukalaisten hyökkäys planeetalle, jolla sijaitsee maanväestön siirtokunta. Edessäsi näytöllä näet laivasi, joka sinun johdollasi liikkuu kohti avaruusoliota. Kun olet saavuttanut tietyn etäisyyden, sinun on avattava tuli heihin. Ampumalla tarkasti amput alas vihollisen laivoja ja tästä saa pisteitä Pixel Star Battle -pelissä. Vihollinen tulee myös sinua kohti. Avaruudessa ohjaamalla sinun on vältettävä vihollisen ohjuksia.