Pelissä Evil Teacher Baldi osallistut useiden pelaajaryhmien välisiin taisteluihin, jotka käydään Kogama-universumissa. Kun olet valinnut vastakkainasettelun puolen, siirryt joukkueena kohti vihollisen tukikohtaa. Sinun tehtäväsi on vangita hänen lippunsa. Tätä varten sinun on tuhottava vihollisen hahmoja aseiden avulla. Heti kun joku ryhmästäsi nappaa lipun, sinulle myönnetään voitto Evil Teacher Baldi -pelissä ja siirryt pelin seuraavalle tasolle.