Pelissä Zen Cube 3d ratkaiset pulman, joka kuuluu luokkaan kolme peräkkäin. Edessäsi näytöllä näet kuution, joka koostuu pienistä kuutioista. Jokaisessa pienessä kuutiossa näet jonkin kohteen sovelletun kuvan. Hiirtä käyttämällä sinun on vedettävä kuutiot samoilla kuvilla erityiseen paneeliin. Asettamalla kolme identtistä kuvaa yhdelle riville, näet kuinka ne katoavat pelikentältä ja saat tästä pisteitä Zen Cube 3d -pelissä.